کلونینگ توالی کامل ژنوم ویروس موزائیک توتون

thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی
author بنت الهدی قویدل
adviser فرهاد شکوهی فر محمد علی ابراهیمی
publication year 1393

abstract

چکیده فارسی ویروس موزائیک توتون (tmv) ، یکی از مهمترین عوامل بیماریزا در سراسر دنیا است که بیش از 200 گونه گیاهی را آلوده می نماید. هر یک از اجزای مختلف ژنوم دارای نقش مهمی در ساختار ژنوم ویروس می باشد، از جمله پروتئین حرکتی که در حرکت سلول به سلول در tmv موثراست و پروتئین پوششی که نقش مهمی در پایداری و انتقال ویروس ایفا میکند. درایران در خصوص تعیین توالی کامل ژنوم ویروس موزائیک توتون تا کنون اقدامی صورت نگرفته است. لذا تعیین توالی ویروس و مطالعه تفاوت های جدایه های موجود در کشور با اطلاعات موجود در منابع از جمله اقدامات اولیه و ضروری جهت انجام مطالعات مولکولی روی این ویروس است، بنابراین با هدف بررسی توالی ژن کدکننده پروتئین حرکتی و پروتئین پوششی در جدایه گزارش شده از ایران و مقایسه توالی تعیین ترادف شده با جدایه های مختلف در بانک ژن ncbi مطالعه حاضر انجام شد. توالی ژن کدکننده این پروتئین ها در جدایه های مناطق مختلف دنیا گزارش شده است. استخراج rna ژنومی ویروس از برگ گیاهان توتون آلوده بدست آمد و با استفاده از پرایمر psh60-r1 مرحله ساخت cdna انجام شد. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی psh63-f و psh60-r1 منطقه کدکننده پروتئین حرکتی و پروتئین پوششی تکثیر و بصورت دو جهته توالی یابی شد. همردیفی توالی بدست آمده با توالی مشابه از نژادهای مختلف انجام شد و درخت خویشاوندی رسم گردید. نتایج نشان داد جدایه گزارش شده از ایران با نژاد tmv-u1 قرابت بالائی دارد. از بین 799 جایگاه در سطح نوکلئوتید برای پروتئین حرکتی 6 جهش در مقایسه با نژاد tmv-u1 مشاهده و در مجموع 266 اسید آمینه 2 جهش دیده شد. آنالیزهای انجام شده براساس توالی نوکلئوتیدی کد کننده ناحیه پروتئین پوششی ویروس در مقایسه با نژاد tmv-u1 2 جهش در سطح نوکلئوتید را نشان داد. در توالی های بالادست و بینابین دو ژن کدکننده پروتئین پوششی و حرکتی نیز جهش هایی مشاهده شد. جهش در این مناطق به دلیل نقش تنظیمی در بیان ژن حائز اهمیت است.

similar resources

تشخیص ویروس موزائیک توتون در سیگارهای ایرانی

full text

خالص‌سازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس

ویروس موزائیک زرد کدو (Zucchini yellow mosaic virus) ازنمونه‌های کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به‌عنوان جدایه فارس این ویروس ((ZYMV-F به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. ZYMV-F در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافت‌های آلوده برای خالص‌سازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتی‌سرمب...

full text

خالص سازی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژنوم کامل ویروس موزائیک زرد کدو- جدایه فارس

ویروس موزائیک زرد کدو (zucchini yellow mosaic virus) ازنمونههای کدوی دارای علایم موزائیک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به عنوان جدایه فارس این ویروس ((zymv-f به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. zymv-f در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافتهای آلوده برای خالصسازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتیسرمبه دست آمده...

full text

کلونینگ ژن پروتئین F ویروس نیوکاسل و تعیین توالی آن

ویروس عامل بیماری نیوکاسل (NDV) یکی از مهمترین عوامل بیماری های ویروسی طیور می باشد ، که سبب واگیری و مرگ ومیر شدید در طیور و گونه های متعددی از پرندگان می شود.پروتئین F ویروس جهت نفوذ و تکثیر ویروسی در حیوانات آلوده نقش محوری دارد. کلونینگ و بیان ژنوم کد کننده پروتئین F جهت تولید واکسن تحت واحد و همجچنین تولید آنتی بادی مونوکلنال علیه پروتئین F می تواند گتمهای جدیدیبرای شناسایی و پیشگیری از بی...

full text

اثر دما بر خصوصیات بیولوژیک ویروس های موزائیک جنوبی مرغ و موزائیک کوتولگی ذرت و تعیین ترادف ژنوم کامل ویروس موزائیک جنوبی مرغ

نزدیکی بیولوژیکی، سرولوژیکی و مولکولی ویروس موزاییک جنوبی مرغ (bermuda grass southern mosaic virus, bgsmv) با ویروس خسارت زای موزائیک کوتولگی ذرت (mdmv) و همچنین پراکنش وسیع آن در مناطق جنوبی ایران از دلایل اصلی این پژوهش می باشد. آزمایش های نشان داد گیاه قیاق در مایه زنی مکانیکی با درصد خیلی پایین، به bgsmv آلوده می شود و شدت بیماری هر دو ویروس bgsmv و mdmv با افزایش دما روند صعودی دارد. ترادف...

15 صفحه اول

تعیین توالی کامل جدایه ایرانی ویروس موزاییک چغندرقند

ویروس موزاییک چغندر (Beet mosaic virus, BtMV)، تنها پوتی‌ویروس آلوده‌کننده چغندرقند بوده و امروزه در سراسر چغندرکاری‌های جهان پراکنش دارد. در مطالعه حاضر ژنوم کامل جدایه‌ای از این ویروس (Ir-VRU) با استفاده از آغازگرهای دژنره عمومی پوتی‌ویروس‌ها، آغازگرهای اختصاصی طراحی شده و همچنین روش 5'-RACE برای اولین بار در ایران توالی یابی شد. ژنوم کامل جدایه ایرانی BtMV، بدون در نظر گر...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}

document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی

Keywords

کلونینگ ویروس موزائیک توتون جهش تعیین توالی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com